表观组研究 甲基化测序

TAPS+ 甲基化&基因组检测

新一代无亚硫酸盐甲基化测序技术,单建库同步获得甲基化信号与基因组变异信息,开启多模态表观基因组研究新范式。

>98%
5mC转化率
3合1
甲基化+变异+片段组学
低至5ng
cfDNA起始量
FFPE
降解样本兼容
TAPS+ Workflow Single Library · Multi-Omics
m m TET1 + Py-Borane 5mC → 5caC → DHU Enzymatic Oxidation + Mild Reduction No bisulfite · No harsh acid PCR & Sequencing 5mC/5hmC Methylation SNV/Indel CNV Fragment -omics
单建库 · 多组学输出
TAPS+ v2
无亚硫酸盐
产品概述

甲基化组 + 基因组,一举两得

TAPS+ 是新一代无亚硫酸盐甲基化测序技术,依托TET酶促氧化与温和还原反应完成甲基化位点的精准转化,全程无需酸处理,有效保护DNA完整性与遗传信息。

无亚硫酸盐

酶促转化,温和无损

多模态信息

甲基化+变异+片段组学

高灵敏度

低起始量,FFPE兼容

跨平台兼容

二代、三代、四代测序

应用领域

广泛覆盖科研与临床转化场景

肿瘤早筛与MRD监测

多模态特征(甲基化+SNV+片段组学)联合提升早筛灵敏度与特异性,支持治疗反应评估与微小残留病监测。

基础与转化研究

肿瘤学、发育生物学、衰老研究、神经生物学等方向的表观基因组全景解析。

遗传病筛查

基因突变与甲基化异常同步检测,一站式获得遗传与表观变异信息,支持早期筛查。

动植物疾病研究

宿主甲基化动态、免疫-病原表观调控网络研究,揭示疾病发生发展的表观机制。

技术原理

酶促氧化 + 温和还原,精准转化

TAPS+ 通过TET1氧化酶与吡啶硼烷还原两步反应,实现甲基化胞嘧啶的精准识别,全程无酸处理,保护DNA完整性与遗传变异信息。

原始DNA m 5mC / 5hmC Methylated Cytosine TET1 Oxidation 5-羧基胞嘧啶 caC 5caC Oxidized Intermediate Py-Borane Reduction 二氢尿嘧啶 DHU DHU Reduced Product PCR Sequencing 5mC → T C → C
双向测序比对正反链信息,精准区分甲基化胞嘧啶、未甲基化胞嘧啶与SNV
一次测序同步获得:全基因组甲基化信号 + SNV/Indel/CNV遗传变异 + DNA片段组学特征

传统亚硫酸氢盐测序 (BS-seq)

  • 强酸强碱导致DNA严重降解,文库复杂度低、覆盖度不足
  • 遗传信息丢失:无法区分C→T突变与甲基化转换
  • FFPE降解样本与低起始量样本兼容性较差

TAPS+ 无亚硫酸盐技术

  • 酶促反应温和无损,DNA完整性好,文库复杂度与覆盖度更高
  • 双向测序+正反链比对,同时鉴定甲基化、未甲基化C和SNV/Indel/CNV
  • 兼容FFPE降解样本、低起始量样本(低至1ng)和cfDNA样本
技术优势

七大核心技术优势

从样本处理到数据分析,TAPS+ 在多个维度展现出优于传统方法的性能表现。

多模态分析

单文库同步实现5mC/5hmC甲基化、SNV、Indel、CNV和片段组学分析,无需重复建库,节省样本与成本。

精准可靠

5mC+5hmC转化率超98%,假阳性率低于0.3%,覆盖高甲基化与低甲基化全区域,结果准确可重复。

更高覆盖度

提升文库复杂度与基因组覆盖度,提高序列比对率,同等测序深度下提升CpG位点的有效覆盖。

广泛兼容

无损流程兼容FFPE降解样本和低起始量样本(gDNA低至1ng,cfDNA低至5ng),珍贵样本也能获得优质数据。

简便快捷

约6小时即可完成文库构建,操作流程简便,易于自动化,无需纯化柱,减少手工操作误差。

高效分析

计算分析时间较传统方法缩短30%以上,节省分析耗时与计算成本,更快获得研究结果。

跨平台兼容

无缝衔接二代、三代和四代测序平台,适配不同研究场景与读长需求,灵活选择测序方案。

性能数据

多项性能指标表现优异

与传统BS-seq及EM-seq v2相比,TAPS+ 在转化率、灵敏度、覆盖度等关键指标上均有提升。

>98%
5mC转化率
高效转化
<0.3%
假阳性率
准确可靠
SNV检测灵敏度
优于EM-seq v2
≈WGS
CNV分析
与未转化文库相当
↑CpG
cfDNA覆盖
同等深度更高覆盖
6h
建库时间
快速便捷
性能指标 TAPS+ 传统BS-seq EM-seq v2
转化原理 酶促氧化+温和还原 亚硫酸氢盐脱氨 酶促脱氨
5mC转化率 >98% ~99% ~99%
假阳性率 <0.3% ~0.5% ~0.5%
SNV检测 支持,灵敏度高 不支持(信息丢失) 有限支持
CNV分析 与WGS相当 偏差较大 较好
DNA完整性 良好(无损) 严重降解 较好
FFPE样本 兼容 兼容性差 一般
cfDNA片段组学 完整保留 严重破坏 部分保留
最低起始量(cfDNA) 5ng ~50ng ~10ng
建库时间 约6小时 约12-16小时 约8小时

* 数据基于已发表文献及内部验证实验,实际表现因样本状态与实验条件而异。

生信分析

全面的生信分析内容

从基础数据质控到高级多组学整合,提供完整的甲基化与基因组变异分析解决方案。

基础分析

数据质控

碱基质量、比对率、甲基化转化率全面评估

CpG位点甲基化水平定量

全基因组范围单碱基分辨率甲基化水平检测

差异甲基化位点(DMP)分析

组间差异甲基化位点筛选与统计检验

差异甲基化区域(DMR)分析

差异甲基化区域鉴定与注释

甲基化功能注释

CpG岛、启动子、基因体、增强子等功能区域注释

SNV/Indel 检测

基因组单核苷酸变异与小插入缺失鉴定

CNV 分析

基因组拷贝数变异检测与注释

高级分析(可选)

DNA片段组学分析

cfDNA片段长度分布、末端基序、核小体定位等

肿瘤溯源 / 组织去卷积

基于甲基化特征的肿瘤组织来源预测与成分解析

甲基化与基因组变异联合分析

多组学数据整合,挖掘表观-遗传调控关系

通路富集分析(GO/KEGG)

差异甲基化基因的功能富集与通路分析

肿瘤标志物筛选

基于机器学习的诊断/预后标志物筛选与验证

生存分析与预后模型

Kaplan-Meier、Cox回归、预后风险评分模型构建

可视化报告

Circos图、热图、散点图、火山图等多种图表

样本要求

多种样本类型,灵活送样

TAPS+ 技术兼容多种样本类型,从高纯度gDNA到珍贵FFPE与cfDNA样本,均可获得高质量数据。

基因组DNA

推荐≥1µg,最低10ng

cfDNA

推荐≥20ng,低至5ng

FFPE

支持,兼容降解样本

全血/组织/细胞

常规样本量即可

纯度要求

OD260/280 = 1.7~1.9

送样建议

不同样本类型的采集、保存与运输要求不同,建议送样前联系我们获取详细的样本指南。对于珍贵样本或特殊样本类型,我们的技术团队可提供一对一的实验设计咨询。

获取样本指南 →
服务方案

三档服务方案,按需选择

从标准分析到定制化研究,提供灵活的服务方案满足不同研究需求。

基础版

标准分析方案

适合初次开展甲基化研究的项目

  • 数据质控与预处理
  • CpG甲基化水平定量
  • 差异甲基化位点(DMP)分析
  • 差异甲基化区域(DMR)分析
  • 甲基化功能注释
  • SNV/Indel 检测
  • CNV 分析
周期视项目而定
咨询详情
定制版

定制化研究方案

适合复杂项目与多组学整合研究

包含高级版全部内容
  • 定制化实验方案设计
  • 肿瘤溯源/组织去卷积
  • 肿瘤标志物筛选与验证
  • 生存分析与预后模型构建
  • 多组学整合分析
  • 一对一技术支持与数据解读
周期视项目而定
定制方案
技术应用场景

典型应用场景解析

TAPS+ 凭借其多模态、低起始量、高灵敏度的特点,在多个研究领域展现出重要的应用价值。

肿瘤早筛早诊

基于cfDNA的TAPS+检测可同时获取甲基化信号、SNV/CNV变异和片段组学特征,三种模态联合分析显著提升肿瘤早筛的灵敏度与特异性,为癌症早期发现提供更可靠的技术支撑。

cfDNA 片段组学 肿瘤溯源

MRD监测与疗效评估

通过多维度的分子特征(甲基化模式、体细胞突变、CNV)追踪微小残留病,比单一标志物更灵敏地反映肿瘤负荷变化,辅助临床治疗决策与预后判断。

MRD 疗效评估 预后判断

发育生物学研究

在胚胎发育、细胞分化与重编程过程中,TAPS+ 可同时解析甲基化重编程动态与基因组变异背景,为揭示发育过程中表观遗传调控机制提供更全面的分子视角。

胚胎发育 细胞分化 重编程

衰老与慢病研究

结合甲基化时钟与基因组变异信息,系统研究衰老相关的表观遗传漂移与遗传累积效应,为衰老生物学与慢性疾病机制研究提供多维度数据支撑。

甲基化时钟 表观衰老 慢病机制
文献精选

已发表高水平研究论文

TAPS 系列技术已在 Nature Biotechnology、Nature Methods、Science Advances 等高水平期刊发表多篇研究论文。

Nat Commun 2025

Multimodal cell-free whole-genome TAPS

cfDNA全基因组多模态TAPS技术,同步解析甲基化、变异与片段组学特征。

Nat Methods 2025

Single-cell multi-omic detection of DNA methylation

单细胞多组学甲基化检测技术,实现更高灵敏度的单细胞表观基因组分析。

JACS 2025

Mechanistic insights into borane-mediated conversion

硼烷介导转化的机制研究,深入解析TAPS化学反应机理。

Nucleic Acids Res 2022

Whole-genome long-read TAPS

全基因组长读长TAPS技术,实现长片段单分子甲基化与单倍型分析。

Sci Adv 2021

Cell-free DNA TAPS for early cancer detection

基于cfDNA TAPS的癌症早期检测研究,验证其在肿瘤早筛中的应用潜力。

Genome Biol 2020

Accurate targeted long-read DNA methylation

精准靶向长读长DNA甲基化检测,实现目标区域单分子级表观遗传分析。

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常见问题

您可能想了解的问题

TAPS+ 和传统WGBS有什么区别?

传统WGBS(全基因组亚硫酸氢盐测序)使用亚硫酸氢盐将未甲基化的C转化为U,进而在测序中被读取为T。这一过程需要强酸条件,会导致DNA严重降解,文库复杂度低,且遗传信息丢失(无法区分C→T突变与甲基化转换)。

TAPS+ 采用酶促氧化(TET1)+ 温和还原(吡啶硼烷)的方式,将甲基化的C(5mC/5hmC)逐步转化为DHU,测序中被读取为T。该方法温和无损,DNA完整性好,可同时获得甲基化信号、SNV/Indel/CNV和片段组学信息,且兼容FFPE和低起始量样本。

TAPS+ 可以同时检测哪些信息?

TAPS+ 一次建库一次测序可同时获得三类信息:(1)全基因组甲基化信号:5mC和5hmC的单碱基分辨率甲基化水平;(2)基因组变异信息:SNV、Indel和CNV,这是传统BS-seq无法做到的;(3)DNA片段组学特征:cfDNA样本中可保留完整的片段长度分布、末端基序、核小体定位等片段组学信息。这种多模态特性使得TAPS+特别适合肿瘤早筛、MRD监测等需要多维数据联合分析的应用场景。

TAPS+ 的样本起始量要求是多少?

TAPS+ 对样本起始量的要求因样本类型而异:

  • 基因组DNA(gDNA):推荐≥1µg,最低可接受10ng;
  • cfDNA:推荐≥20ng,低至5ng可尝试;
  • FFPE样本:支持,建议提供足量切片;
  • 全血/组织/细胞:常规样本量即可。

对于珍贵样本或低于推荐量的样本,我们的技术团队会评估可行性并提供专业建议,尽可能满足研究需求。

cfDNA样本可以做TAPS+吗?

可以,TAPS+ 非常适合cfDNA样本。传统亚硫酸氢盐处理会导致cfDNA进一步严重片段化,丢失珍贵的片段组学信息。而TAPS+的酶促转化过程温和无损,能够完整保留cfDNA的片段长度分布、末端基序、核小体定位等片段组学特征。同时,TAPS+在同等测序深度下可提供更高的CpG位点覆盖度,使组织溯源结果更加准确可靠。这些特性使得TAPS+成为cfDNA甲基化研究的优选方案,尤其适合肿瘤早筛、MRD监测等液体活检应用。

TAPS+ 的转化率和准确率如何?

TAPS+ 的5mC+5hmC总转化率超过98%,假阳性率低于0.3%。与传统BS-seq和EM-seq v2相比,TAPS+在保持高转化率的同时,显著降低了DNA损伤,提升了文库复杂度和基因组覆盖度。在SNV检测方面,TAPS+比EM-seq v2和BS-seq更灵敏;CNV分析结果与未转化的WGS文库相当;cfDNA样本中同等深度下可获得更高的CpG覆盖。不同起始量的实验数据也显示出高度一致性,证明了方法的稳定性和可靠性。

TAPS+ 可以做哪些物种?

TAPS+ 技术本身不依赖于物种,原则上任何具有DNA甲基化的物种都可以使用。目前已成功应用于人类、小鼠、大鼠、拟南芥、水稻等多种动植物物种。对于有参考基因组的物种,分析流程较为完善;对于无参考基因组的物种,可以通过de novo组装后进行甲基化分析。具体项目中,我们的技术团队会根据研究物种和研究目的提供定制化的实验与分析方案建议。

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