染色质免疫共沉淀测序（Chromatin Immunoprecipitation Sequencing, ChIP-seq）是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典技术，也是表观基因组学研究的金标准方法。通过甲醛交联将细胞内与DNA结合的蛋白质固定在染色质上，超声破碎将染色质打断为200-500bp片段，使用靶标蛋白特异性抗体沉淀蛋白-DNA复合物，解交联纯化DNA后建库并进行高通量测序，将测序reads比对到参考基因组，获得靶蛋白在全基因组上的结合位点分布图。
通过特异性抗体富集与靶蛋白结合的DNA片段，经高通量测序后在全基因组范围内精确定位蛋白结合位点。
固定体内蛋白-DNA相互作用
超声打断至200-500bp
靶标抗体特异性富集
释放并纯化ChIP DNA
文库构建与质量控制
主流高通量测序平台
Peak Calling与功能注释
主流高通量测序平台系列，数据产出稳定，质量可靠。
适用于多种蛋白-DNA互作研究靶标，涵盖表观修饰与调控因子。
严格参照ENCODE实验与分析规范，从实验到分析全流程多重质控，确保数据质量与结果可靠性。
一次性鉴定靶蛋白在全基因组范围的结合位点，无偏向性覆盖整个基因组。
可精确鉴定转录因子结合位点motif，定位核心调控元件及功能区域。
组蛋白修饰和转录因子结合研究的行业标准方法，文献认可度高。
适用于表观遗传调控、转录调控、发育分化、疾病机制等多个研究方向。
参照ENCODE实验与分析规范，多重质控确保数据质量，结果可追溯。
累计完成千余例项目，覆盖人、大小鼠、斑马鱼、拟南芥等20+物种。
根据靶标类型选择合适的测序深度与读长，确保Peak Calling的准确性与可靠性。项目周期视项目而定。
| 靶标类型 | 推荐测序深度 | 测序读长 |
|---|---|---|
| 组蛋白修饰（窄峰型） | 20~30M clean reads | PE 150 bp |
| 组蛋白修饰（广域型） | 40~50M clean reads | PE 150 bp |
| 转录因子/辅助因子 | 20~30M clean reads | PE 150 bp |
| RNA聚合酶（Pol II） | 30~40M clean reads | PE 150 bp |
| Input对照 | 10~15M clean reads | PE 150 bp |
* 以上为推荐参数，具体测序策略根据研究目的与样本情况定制。项目周期视项目而定。
从原始数据质控到Peak Calling、功能注释与可视化，提供完整的生信分析流程，并支持多种高级定制分析。
规范的样本处理是ChIP-seq成功的关键。请严格按照以下要求准备样本，如有疑问请联系技术支持。
推荐量：5×10⁶ ~ 1×10⁷ cells
最低量：2×10⁶ cells
推荐量：100 ~ 200 mg
最低量：50 mg
推荐量：5 ~ 10 ng
最低量：1 ng
提供基础、高级、定制三种服务方案，根据研究目标与预算灵活选择。项目周期视项目而定。
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