分子互作研究 服务目录号 JZ040102

RNA Pull Down
RNA-蛋白互作核心技术

基于生物素标记RNA探针富集RNA结合蛋白,联合Western Blot与质谱检测,解析转录后调控机制与疾病相关互作网络

3+下游方案
WB / MS / qPCR
低丰度富集
靶蛋白-RNA复合物
互作验证
与RIP结果相互验证
生信分析
GO / KEGG / PPI
RNA Pull-Down Assay JZ040102
B RBP Magnetic Beads Biotin-labeled RNA Probe RNA + RBP Enrichment & Detection
RNA-蛋白互作富集
v1.0
WB / 质谱双验证
产品概述

RNA Pull Down · 解析RNA与蛋白互作的核心技术

RNA pull-down是研究细胞内RNA与蛋白或与RNA结合情况的技术。通过将RNA进行标记(生物素探针),再与细胞裂解液共同孵育,从而形成RNA-蛋白质复合物,之后再分离复合物得到蛋白质/RNA。通过western blot或mass Spectrometry检测蛋白质,通过定量PCR或高通量测序来鉴定与其相互作用的RNA分子。

应用领域

RNA结合蛋白筛选与验证
非编码RNA靶蛋白鉴定
转录后调控机制研究
疾病相关RNA-蛋白互作网络
技术原理与实验流程

标准化实验流程

从RNA探针制备到下游检测,全流程标准化管控

1

靶RNA制备及生物素标记

目标RNA体外转录
生物素探针标记

2

磁珠富集RNA

链霉亲和素磁珠
富集标记RNA

3

RNA结合蛋白孵育

细胞裂解液共孵育
形成RNA-蛋白复合物

4

RNA结合蛋白洗脱

洗涤非特异性结合
洗脱结合蛋白

5

银染质检

SDS-PAGE分离
银染检测富集效果

6

WB / MS检测

Western Blot验证
质谱鉴定蛋白

技术优势

三大技术优势

富集效率高、验证体系完善、下游方案灵活

低丰度复合物富集

基于生物素-链霉亲和素高亲和力体系,可高效富集低丰度目的蛋白-RNA复合物,显著提升检测灵敏度。

与RIP结果相互验证

RNA pull-down以RNA为钓饵富集蛋白,RIP以蛋白为钓饵富集RNA,两种技术可互为验证,确保互作关系的可靠性。

灵活的下游检测方案

支持多种下游检测方式:Western Blot靶向验证、质谱无偏筛选、qPCR及高通量测序检测互作RNA,灵活适配不同研究需求。

生信分析内容

核心分析模块

从质谱数据质控到互作网络分析,提供系统化生物信息分析

蛋白质谱数据质控与鉴定

原始数据质控、蛋白鉴定与定量、肽段匹配质量评估

差异蛋白筛选

实验组与对照组差异蛋白统计、火山图与热图展示

GO/KEGG功能富集分析

GO生物过程/分子功能/细胞组分、KEGG通路富集分析

蛋白互作网络分析

基于STRING等数据库构建PPI网络,筛选hub蛋白

RNA-蛋白互作关联分析

整合RNA与蛋白组数据,构建RNA-蛋白互作调控网络

* 具体分析内容可根据研究需求灵活调整,详询技术顾问

样本要求

样本要求

细胞或组织样本,专业技术人员全程指导样本准备

样本类型 推荐起始量 保存与运输 注意事项
细胞样本 > 1 × 108 个细胞 -80℃ 保存,干冰运输 收集细胞后PBS洗涤,离心弃上清,细胞沉淀迅速液氮速冻后转-80℃保存;避免反复冻融
组织样本 > 500 mg -80℃ 保存,干冰运输 新鲜组织取材后立即液氮速冻,-80℃保存;避免组织降解,送样前确认样本质量

* 样本量不足或特殊样本请咨询技术顾问,送样前建议先进行样本质量评估

交付内容与流程

交付内容

完整实验报告与分析结果,数据详尽可追溯

完整实验报告

实验方法与流程详细说明
RNA探针制备与标记质控数据
银染检测结果图片
Western Blot结果图(WB方案)

质谱鉴定与分析结果(MS方案)

蛋白质谱鉴定与定量结果
差异蛋白筛选与可视化
GO/KEGG功能富集分析
蛋白互作网络分析报告

* 项目周期视项目而定,受样本数量、检测方案及分析内容等因素影响

服务方案

三种服务方案 · 灵活选择

根据研究目的与检测需求,选择合适的服务方案

基础版

RNA Pull Down + WB验证

适用于已知候选蛋白的靶向验证研究,通过Western Blot检测特定蛋白与RNA的结合。

  • RNA探针制备与标记
  • RNA Pull Down实验
  • 银染质检
  • Western Blot检测(指定蛋白)
高级版

RNA Pull Down + 质谱鉴定

适用于无偏筛选RNA结合蛋白,通过质谱技术全面鉴定与目标RNA互作的蛋白谱。

  • 基础版全部内容
  • 质谱鉴定与定量
  • 差异蛋白筛选
  • GO/KEGG富集分析
  • 蛋白互作网络分析
定制版

定制化研究方案

针对复杂研究需求,提供RNA-蛋白互作关联分析、多组学整合分析等定制化服务。

  • 高级版全部内容
  • RNA-蛋白互作关联分析
  • 多组学整合分析
  • 个性化分析与图表定制
  • 一对一技术顾问全程跟进
常见问题

FAQ

关于RNA Pull Down服务,您可能想了解的问题

1. RNA Pull Down和RIP有什么区别?应该怎么选?
两种技术都是研究RNA-蛋白互作的常用方法,但研究方向相反:
RNA Pull Down:以目标RNA为钓饵,富集与其结合的蛋白质。适合研究特定RNA的结合蛋白谱、筛选ncRNA的靶蛋白等。是从RNA出发寻找蛋白。
RIP(RNA Immunoprecipitation):以目标蛋白为钓饵,富集与其结合的RNA。适合研究特定蛋白结合的RNA谱。是从蛋白出发寻找RNA。
建议将两种技术联合使用,从正反两个方向验证RNA-蛋白互作关系,结果更为可靠。
2. 目标RNA需要自己提供吗?可以合成哪些类型的RNA?
目标RNA可由客户提供质粒或序列信息,我们负责体外转录与生物素标记。支持的RNA类型包括:
  • mRNA片段:
  • 非编码RNA:
  • RNA全长与截短体:

具体RNA序列长度与结构复杂度可能影响制备效率,建议提前咨询技术顾问。
4. 细胞样本量为什么需要这么多?样本量不够怎么办?
RNA Pull Down实验需要较大的样本量,主要原因是:
  • 富集效率限制:
  • 多组复孔需求:

如果样本量不足,建议咨询技术顾问,我们会根据您的样本情况和研究目的评估可行性,并提供优化建议。
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