长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）是一类长度大于200nt的非编码RNA分子，参与表观遗传调控、转录调控及转录后调控等多个层面，在发育分化、疾病发生、肿瘤进展等生物学过程中发挥重要作用。lncRNA测序采用去rRNA + 链特异性建库方案，同时检测mRNA与lncRNA的表达谱，通过生物信息学分析鉴定新的lncRNA并预测其功能，是研究非编码RNA调控机制的核心技术。
去rRNA + dUTP链特异性建库，确保lncRNA鉴定准确可靠
去rRNA建库方案，同时保留编码与非编码RNA
dUTP链特异性建库，保留转录本方向信息，反义lncRNA鉴定更准确
CNCI/CPC/Pfam三重编码潜能预测筛选，lncRNA鉴定更可靠
支持cis/trans两种调控模式的功能预测
| 测序模式 | PE 150 |
| 推荐数据量 | 10-12 G clean data /样本 |
| 数据质量 | Q30 ≥ 85% |
| 项目周期 | 视项目而定 |
建库 + 鉴定 + 分析 + 服务，全方位保障研究质量
经过优化的去rRNA建库流程，rRNA残留率稳定低于5%，有效数据占比高。
dUTP链特异性建库方法，完整保留转录本方向信息，反义lncRNA鉴定更准确。
CNCI/CPC/Pfam三种方法联合进行编码潜能预测，多重筛选降低假阳性，lncRNA鉴定结果更可靠。
顺式(cis) + 反式(trans)双维度调控分析，深入解析lncRNA潜在生物学功能与调控机制。
支持组织、细胞、FFPE、外泌体等多种样本类型，专业样本处理经验保障实验成功率。
经验丰富的生信团队提供标准分析与高级分析，支持ceRNA网络、共表达网络等深度分析。
标准分析 + 高级分析可选，满足不同研究深度需求
原始数据质控与过滤
参考基因组比对
mRNA + lncRNA表达定量（TPM/FPKM/Counts）
lncRNA鉴定（CNCI/CPC/Pfam三重筛选）
lncRNA分类（lincRNA/intronic/antisense/sense overlapping）
样本相关性与PCA分析
差异表达分析（mRNA + lncRNA）
GO/KEGG功能富集分析
lncRNA顺式调控预测（cis）
lncRNA反式调控预测（trans）
可变剪接分析
融合基因分析
新转录本预测
ceRNA调控网络分析
共表达网络构建
多种样本类型兼容，专业技术团队全程指导样本准备
| 样本类型 | 推荐起始量 | 保存与运输 | 注意事项 |
|---|---|---|---|
| 总RNA | 推荐5μg，最低2μg RIN ≥ 6.5 |
-80℃ 保存，干冰运输 | RNA完整性好，无降解；OD260/280=1.8-2.1；避免反复冻融 |
| 组织样本 | 100-200mg，最低50mg | -80℃ 保存，干冰运输 | 新鲜组织离体后30分钟内液氮速冻，避免RNase污染；禁止使用RNAlater等保存液 |
| 细胞样本 | 5×106 ~ 1×107 细胞 最低 1×106 |
-80℃ 保存，干冰运输 | 收集细胞后PBS洗涤，去除上清后液氮速冻或直接加裂解液；避免培养基残留 |
| FFPE样本 | 5-10张切片（10μm） 最低 3张 |
常温保存，常温运输 | FFPE样本需注明固定时间，建议固定时间不超过24小时；切片厚度10μm |
* 生物学重复：每组至少3个生物学重复
* 样本量不足或特殊样本请咨询技术顾问
根据研究深度灵活选择，支持定制化分析内容
标准分析内容，满足常规研究需求
去rRNA + 链特异性建库
PE150测序，10G clean data
mRNA + lncRNA表达定量
lncRNA鉴定与分类
差异表达与GO/KEGG富集
包含调控预测，深入功能挖掘
基础版全部分析内容
lncRNA顺式调控预测（cis）
lncRNA反式调控预测（trans）
可变剪接分析
新转录本预测与融合基因分析
根据研究需求定制分析内容
高级版全部分析内容
ceRNA调控网络分析
共表达网络构建（WGCNA）
个性化图表与报告定制
一对一技术顾问支持
关于lncRNA测序服务，您可能想了解的问题
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