转录组研究

定量PCR(qPCR)
转录组验证服务

基于ABI QuantStudio高端平台,提供SYBR Green与TaqMan双方法、从单基因到384孔高通量表达谱的完整qPCR验证服务,为转录组研究提供可靠的独立验证手段。

2种检测法
SYBR / TaqMan
双通量
96 / 384 孔
高灵敏度
单拷贝可检
严格质控
NTC / NRT / 复孔
qPCR Amplification QuantStudio 5
Threshold Cycle Number Rn
96孔板检测
3 technical replicates
RNA-seq验证
产品概述

实时荧光定量PCR · 转录组结果独立验证

实时荧光定量PCR(qPCR)通过在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,通过CT值对未知模板进行相对或绝对定量分析。是转录组研究中高通量测序结果常用的独立验证手段,用于确认差异表达基因的真实性与表达趋势。

两种检测方法

SYBR Green I

荧光染料非特异性结合双链DNA,通用性强、成本较低,需通过溶解曲线验证扩增特异性。

通用性强,无需设计探针
成本较低,适合大量基因筛选
溶解曲线验证扩增特异性

TaqMan 探针法

利用Taq酶外切酶活性切割荧光探针释放信号,特异性高、支持多重检测,需设计特异性探针。

特异性更高,不受引物二聚体干扰
可多重检测,同反应多基因分析
结果更精准,适合临床诊断级应用

应用领域

RNA-seq/芯片验证
基因表达差异验证
疾病标志物筛选
药物疗效评估
通路激活分析
诊断试剂盒研发
技术原理与实验流程

标准化实验流程 · 严格质控保障

从样本接收到报告交付,全流程SOP标准化操作,多重质控确保结果可靠

1

样本接收

样本核对
登记入库

2

RNA提取质检

总RNA提取
RIN值/浓度检测

3

逆转录

gDNA去除
cDNA合成

4

qPCR检测

引物设计合成
荧光定量检测

5

分析与交付

溶解曲线分析
数据报告交付

两种定量方式

定量方式 原理 适用场景
相对定量(2^-ΔΔCT法) 比较目标基因与内参基因CT值差异,计算相对表达量变化倍数 差异表达基因验证、表达趋势分析、RNA-seq结果验证等大多数转录组研究场景
绝对定量 利用已知浓度标准品制作标准曲线,推算样品中靶基因的绝对拷贝数 病毒载量检测、病原体定量、基因拷贝数变异分析等需要绝对数值的场景
技术优势

七大技术优势

平台 + 质控 + 引物 + 分析 + 服务,全方位保障验证结果可靠

高灵敏度与特异性

ABI QuantStudio高端仪器平台搭配预验证引物,低丰度基因准确检测,单拷贝级灵敏度。

严格质控体系

NTC(无模板对照)、NRT(无逆转录对照)、内参基因、复孔设置多重质控,全面把控实验质量。

专业引物设计

跨内含子设计避免gDNA干扰,全部引物经过预实验验证扩增效率(90%~110%)。

标准化流程

SOP标准化实验操作流程,使用进口试剂(ABI/TaKaRa/Vazyme),确保实验结果稳定可靠。

丰富验证经验

已完成数千例样本、上万个基因的qPCR验证,RNA-seq结果验证命中率高。

深入数据分析

提供一致性分析、标志物筛选、通路分析、生存分析等深入分析内容。

灵活定制方案

从单基因验证到384孔高通量表达谱,从SYBR到TaqMan,灵活定制满足不同研究需求。

服务套餐与技术参数

三档服务套餐 · 按需选择

从小批量验证到高通量表达谱,覆盖不同研究规模需求

入门级

单基因/小批量验证

适合少量候选基因的快速验证,提供RNA提取到分析的完整服务。

样本量:≤ 20样本
基因数:≤ 10基因
包含:RNA提取+逆转录+qPCR检测+分析
推荐
进阶级

差异基因批量验证

适合RNA-seq后批量差异基因验证,含表达谱分析及与测序结果一致性分析。

样本量:≥ 30样本
基因数:10 - 100基因
包含:qPCR阵列+表达谱+一致性分析
高通量

高通量qPCR表达谱

96/384孔定制Primer Panel,针对特定通路或疾病进行高通量表达谱分析。

板型:96 / 384 孔阵列
基因数:40 - 370基因
包含:定制Panel+通路富集+标志物筛选

技术参数

参数 说明
检测平台 Applied Biosystems QuantStudio 5 / 7 Flex
检测通量 96孔 / 384孔 板型可选
反应体系 10µL(96孔)/ 5µL(384孔)
复孔设置 每个样本每个基因3个技术重复
引物扩增效率 90% ~ 110%,R² ≥ 0.99
复孔CV ≤ 5%(CT值 SD ≤ 0.3)
检测动态范围 101 ~ 1010 拷贝/反应
灵敏度 可检测低至单拷贝模板
数据分析内容

基础分析 + 高级分析 · 全面覆盖

从基础定量统计到深入的生物信息挖掘,提供系统化数据分析

基础分析

RNA质检报告

RNA浓度、完整性、纯度检测结果汇总

引物质控

扩增效率验证、溶解曲线分析、标准曲线R²

CT值表

复孔平均CT值、标准差汇总表

相对定量分析

2^-ΔΔCT法计算相对表达量变化倍数

组间差异统计

t检验/ANOVA等统计检验,P值/FDR校正

表达可视化

表达柱状图、箱线图等可视化展示

高级分析(可选)

RNA-seq一致性分析

相关性系数+命中率

差异基因热图

聚类可视化

火山图

批量验证展示

ROC曲线

诊断效能评估

生存分析

KM曲线+Cox回归

聚类分型

表达模式聚类

GO/KEGG富集

通路功能富集分析

PPI蛋白互作

蛋白互作网络构建

通路激活评分

ssGSEA / GSVA

定制化统计

个性化分析需求

* 具体分析内容可根据研究需求灵活调整,详询技术顾问

样本要求

多样本类型 · 灵活送样

接受多种样本类型,专业技术人员全程指导样本准备

样本类型 推荐起始量 最低量 保存与运输 注意事项
总RNA ≥ 2 µg ≥ 500 ng -80℃保存,干冰运输 RIN ≥ 6.5,浓度 ≥ 50 ng/µL,OD260/280 = 1.8 - 2.1
组织 ≥ 50 mg ≥ 20 mg -80℃保存,干冰运输 样本离体后迅速液氮冻存,避免反复冻融;肿瘤样本注明肿瘤细胞含量
细胞 ≥ 1 × 106 ≥ 5 × 105 -80℃保存,干冰运输 收集细胞后PBS洗涤,加入裂解液或TRIzol后冻存;避免细胞凋亡
全血 ≥ 2 mL ≥ 1 mL EDTA抗凝,4℃/冰袋运输 使用EDTA抗凝管,严禁肝素抗凝;采集后24小时内处理或冻存
血清/血浆 ≥ 5 mL ≥ 2 mL -80℃保存,干冰运输 血浆推荐EDTA抗凝;避免溶血;分离后立即冻存
FFPE ≥ 5 张(10 µm) ≥ 3 张 常温保存运输 石蜡包埋时间不超过5年为佳;切片厚度5-10 µm;提供HE染色结果确认肿瘤比例
cDNA ≥ 50 µL(≥ 50 ng/µL) -20℃保存,冰袋运输 需提供逆转录方法及RNA原始质检信息

内参基因推荐

推荐选择 2-3 个内参基因,采用 geNorm 算法筛选合适的内参组合,确保定量结果准确可靠。常用内参包括 GAPDH、ACTB、18S rRNA、β-tubulin 等,具体根据样本类型和研究目的选择。

* 样本量不足或特殊样本请咨询技术顾问,送样前建议先进行样本质量评估

质量控制

多重质控体系 · 结果可靠保障

从样本到数据全链路质控,确保每一份结果的准确性与可靠性

样本质控

RNA浓度、纯度、完整性三重检测,RIN值评估

引物质控

扩增效率90-110%,溶解曲线单峰,R²≥0.99

实验质控

NTC无模板对照 + NRT无逆转录对照,防污染

数据质控

三复孔CV≤5%,内参基因稳定性评估

常见问题

FAQ

关于qPCR转录组验证服务,您可能想了解的问题

2. qPCR验证RNA-seq结果,一般验证多少个基因比较合适?
qPCR验证基因数量取决于研究目的和差异基因数量,一般建议:
  • 基础验证(8-15个基因):选择高、中、低不同表达水平的差异基因各若干个,加上1-2个内参,验证RNA-seq结果的整体可靠性。适合初步验证和常规论文需求。
  • 中等规模验证(20-50个基因):针对关键通路或功能模块的基因进行批量验证,更全面地评估RNA-seq数据质量和差异趋势。适合比较严谨的研究论文。
  • 高通量验证(100+基因):使用96或384孔qPCR阵列,对整条通路或上百个候选基因进行系统性验证,同时可进行标志物筛选和通路激活分析。适合标志物发现等深入研究。
3. 为什么qPCR结果和RNA-seq结果有时不一致?
RNA-seq和qPCR是两种不同的技术平台,结果存在一定程度的不一致是正常的。常见原因包括:
  • 转录本异构体差异:RNA-seq可区分不同转录本异构体,而qPCR引物可能只扩增特定异构体或所有异构体,导致定量范围不同。
  • 低丰度基因:表达量很低的基因在两种平台上的检测误差都较大,一致性通常较差。
  • 技术重复性差异:两种技术各有自身的技术偏差和噪声来源,RNA-seq有测序深度和比对偏好,qPCR有扩增效率差异。
  • 样本批次效应:如果RNA-seq和qPCR使用不同批次的RNA样本,可能引入批次差异。

整体而言,表达趋势一致性(上调/下调方向一致)比具体表达倍数更重要。通常验证命中率在70-90%之间都属于合理范围。
6. 可以只送cDNA样本吗?需要提供什么信息?
可以接收cDNA样本,但为了确保qPCR检测结果的可靠性,建议提供以下信息:
  • 原始RNA的质检结果(浓度、RIN值、OD260/280)
  • 使用的逆转录试剂盒和方法
  • cDNA的浓度和体积(推荐≥ 50 µL,浓度≥50 ng/µL)
  • 是否已去除基因组DNA

请注意:如果您自行完成RNA提取和逆转录,我们无法控制上游实验质量,可能影响最终定量结果的可靠性。如对结果准确性要求较高,建议提供原始样本由我们进行完整的RNA提取到qPCR检测服务。
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邮箱
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