单细胞测序 靶向转录组 预制Panel 高灵敏度

BD Rhapsody™ 单细胞靶向转录组测序(TTA)
高灵敏度靶向基因表达检测

基于BD Rhapsody™单细胞捕获平台,结合定制化靶向引物Panel,对目标基因进行高特异性巢式PCR扩增与测序。靶向测序只富集感兴趣的基因转录本,有效提升低丰度基因的检测灵敏度,降低测序成本,同时提高细胞分群分辨率。支持预制Panel和个性化定制Panel(最多500个基因)。

BD Rhapsody™ Single Cell
Cell Barcode + UMI
微孔+磁珠双捕获
核心优势

为什么选择 BD Rhapsody™ 平台

微孔物理分隔技术带来低多细胞率、高捕获效率和稳定的数据质量

高灵敏度

靶向富集显著提升低丰度转录本的检出效率

高性价比

仅测序目标基因,大幅降低测序成本

高分辨率

提升细胞分群精度,更好区分相似细胞亚群

灵活定制

支持个性化定制(最多500基因),也可在预制Panel基础上补充(最多100基因)

分析简便

数据量适中,更易于标准化分析和多批次数据整合

技术流程

标准实验流程,稳定可靠的数据产出

从样本制备到生信分析,全流程标准化质控,确保实验结果的稳定性与可重复性

1

单细胞悬液制备与质检

细胞悬液制备、活性与浓度检测

2

单细胞mRNA捕获

微孔+磁珠捕获单个细胞mRNA

3

逆转录与巢式PCR扩增

靶向引物富集目标基因

4

靶向文库构建与质检

靶向文库构建、片段质检

5

高通量测序

PE150测序

6

生信分析

靶向基因表达定量与细胞分群

预制Panel

3款预制Panel,快速匹配研究方向

针对肿瘤、免疫和T细胞研究方向的预制Panel,预混即用,同时支持个性化定制与Panel补充

Panel名称 物种 基因数 适用方向
人乳腺癌 Onco BC Panel 389 乳腺癌肿瘤组织研究
免疫反应 Panel 人 / 小鼠 人 399 个 / 小鼠 397 个 单细胞免疫研究
T 细胞 Panel 259 T 细胞单细胞检测
支持个性化定制Panel(最多500基因)
预制Panel可补充最多100个靶向基因
样本要求

样本准备指南

规范的样本制备是高质量单细胞数据的基础,请在送样前参考以下要求

项目 要求
样本类型 新鲜组织、细胞悬液、全血(PBMC)等
细胞总量 ≥ 1×10⁵ 个活细胞
细胞活率 ≥ 80%
细胞直径 ≤ 40 μm
其他要求 无细胞结团,无明显杂质
生信分析内容

全面的生信分析方案

从标准分析到高级分析,提供多维度的单细胞数据挖掘与可视化服务

标准分析

靶向基因表达定量与表达矩阵构建
数据质控与细胞过滤
降维聚类(PCA/UMAP/t-SNE)
细胞亚群鉴定与差异基因分析
Marker基因筛选与细胞类型注释
功能富集分析

高级分析(可选)

细胞拟时序分析
细胞通讯分析
基因调控网络分析
多样本整合比较
应用场景

广泛的研究应用方向

适用于生命科学研究的多个领域,助力高水平科研成果产出

免疫细胞精细分群

免疫细胞亚群深度鉴定与功能研究

肿瘤免疫微环境

肿瘤微环境免疫特征分析

大样本队列筛查

临床队列样本的低成本单细胞检测

目标基因验证

已知目标基因的验证性研究

临床样本检测

临床样本的低成本单细胞检测

生物标志物筛选

细胞分型与生物标志物筛选

推荐测序量

5,000 ~ 20,000 reads/cell(依Panel大小调整)

高通量测序平台,PE150

获取方案
常见问题

FAQ 常见问题解答

关于产品和实验的常见问题,更多问题请联系技术支持

Q 可以自己指定基因做定制 Panel 吗?
A

可以。支持个性化定制 Panel,最多可包含 500 个基因;也可在 BD 预制 Panel 的基础上补充最多 100 个靶向基因。

Q TTA 可以和蛋白组(CITE-seq)一起做吗?
A

可以。BD Rhapsody 平台支持转录组与蛋白组联合检测,TTA 也可与 AbSeq 搭配使用。

05 BD TTA和WTA有什么区别?怎么选?
BD WTA(全转录组分析)覆盖全基因组范围的基因表达,适合探索性研究和新发现;BD TTA(靶向转录组分析)聚焦特定基因panel,测序深度更高、成本更低、数据更稳定,适合大队列验证和biomarker研究。选择建议:前期探索用WTA,后期验证用TTA;预算有限、关注特定通路用TTA;需要全面转录图谱用WTA。中科普瑞可根据研究需求提供专业方案建议。
06 BD TTA靶向转录组的样本要求是什么?
BD TTA要求细胞活性不低于70%,细胞总量建议不少于5×10^5个,细胞浓度在500至1000 cells/μL之间。支持PBMC、细胞系、组织解离细胞、FFPE样本等多种类型。具体样本准备方案需根据样本类型和研究目的确定,送样前建议与技术团队沟通确认。
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